More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3422 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 313 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  69.9 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  70 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  68.86 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  68.51 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  66.09 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  61.64 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  62.33 
 
 		 320 aa  362  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  66.43 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  65.72 
 
 		 337 aa  358  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  64.58 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  63.79 
 
 		 318 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  62.32 
 
 		 309 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  57.33 
 
 		 300 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  60.76 
 
 		 322 aa  330  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  60.76 
 
 		 322 aa  330  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  59.58 
 
 		 333 aa  329  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  59.58 
 
 		 333 aa  329  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  59.79 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  57.91 
 
 		 324 aa  319  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  57.79 
 
 		 329 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  62.2 
 
 		 333 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  58.11 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  54.21 
 
 		 297 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  62.41 
 
 		 336 aa  315  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  55.36 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  51.35 
 
 		 356 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  56.99 
 
 		 373 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  59.18 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  58.48 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  54.61 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  57.49 
 
 		 306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  53.4 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  55.48 
 
 		 302 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  52.94 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  48.45 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  49.7 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  48.11 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  47.52 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  39.64 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  42.36 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  39.71 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  40.43 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.73 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.33 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  38.64 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.71 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.05 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.36 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.02 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  34.23 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  41.52 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.23 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.23 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  34.23 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.55 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.26 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  37.59 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  37.41 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.68 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.33 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.2 
 
 		 321 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  33.33 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.97 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.68 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  37.73 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  37.13 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  36.7 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  33.46 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  40.32 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  35.88 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  38.46 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  35.69 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  37.92 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  33.89 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  37.09 
 
 		 342 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.83 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>