More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2440 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 365 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2598  cation diffusion facilitator family transporter  64.05 
 
 		 405 aa  275  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  38.74 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 366 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  43.84 
 
 		 356 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  40.73 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  35.8 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  35.8 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  41.82 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  39.24 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  39.24 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  36.33 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  37.95 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  28.44 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  32.51 
 
 		 284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  37.38 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  36.56 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  35.78 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.71 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  36.16 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  36.16 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  36.84 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  36.43 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  41.49 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 		 329 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  39.65 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.64 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  31.23 
 
 		 294 aa  153  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  38.51 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  32.76 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  40.79 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  40.5 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  36.21 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  36.21 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  36.21 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  36.21 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  36.21 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  41.96 
 
 		 318 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  35.05 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  32.07 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  36.16 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.65 
 
 		 398 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  34.74 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  37.76 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.77 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  37.83 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  32.98 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0153  cation diffusion facilitator family transporter  31.27 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0646969  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  36 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  37.5 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  42.25 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  37.19 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  38.37 
 
 		 626 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  37.19 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>