More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2050 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 333 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 333 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  81.98 
 
 		 322 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  81.98 
 
 		 322 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  58.84 
 
 		 300 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  63.67 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  60.2 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  56.7 
 
 		 325 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  62.24 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  61.67 
 
 		 318 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  55.07 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  59.72 
 
 		 306 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  57.23 
 
 		 329 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  59.72 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  56.49 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  58.68 
 
 		 314 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  57.95 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  56.03 
 
 		 309 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  54.55 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  53.56 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  55.79 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  50.3 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  57.19 
 
 		 318 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  55.52 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  53.27 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  60.07 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  55.07 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  58.36 
 
 		 346 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  50 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  51.17 
 
 		 306 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  50.15 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  56.6 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  52.71 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  54.61 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 302 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 316 aa  258  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  50.33 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  48.49 
 
 		 309 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  43.2 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  43.3 
 
 		 307 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  43.62 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.33 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  39.72 
 
 		 296 aa  208  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  38.54 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.95 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  38.51 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  37.93 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  35.4 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.44 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  40.08 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.79 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  35.44 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.09 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.32 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.71 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.02 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.71 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.36 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.93 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.14 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.7 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.19 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 		 294 aa  169  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  35.96 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.21 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  30.39 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  37.77 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  36.61 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  36.61 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  35.04 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  37.14 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.05 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  35.99 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.14 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  32.13 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  36.39 
 
 		 342 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  35.52 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  37.1 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  35.52 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  35.52 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>