More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2218 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
297 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  66.33 
 
 
297 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  65.99 
 
 
297 aa  363  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  53.9 
 
 
299 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  55.21 
 
 
326 aa  308  9e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  52.6 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  52.6 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  52.6 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  52.6 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  53.06 
 
 
312 aa  300  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  51.74 
 
 
300 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  51.74 
 
 
300 aa  296  3e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  52.88 
 
 
299 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  52.94 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  54.9 
 
 
316 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  54.9 
 
 
316 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  52.8 
 
 
319 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  48.91 
 
 
305 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 
313 aa  254  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  47.67 
 
 
305 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  43.92 
 
 
305 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  43.92 
 
 
305 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  47.31 
 
 
299 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 
305 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  40.97 
 
 
299 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 
302 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  47.68 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.93 
 
 
299 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  40.64 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.93 
 
 
299 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  39.93 
 
 
299 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.28 
 
 
299 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  40.62 
 
 
299 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.28 
 
 
299 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  40.62 
 
 
299 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  43.82 
 
 
300 aa  209  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  40.46 
 
 
295 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  43.09 
 
 
304 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 
314 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  40.99 
 
 
308 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 
305 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 
352 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  45.56 
 
 
306 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  41.18 
 
 
331 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.47 
 
 
327 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.15 
 
 
307 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  40.26 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 
309 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 
326 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 
304 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  41.37 
 
 
325 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 
325 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  41.92 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 
310 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.43 
 
 
378 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 
298 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 
327 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 
305 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  42.12 
 
 
300 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 
325 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 
325 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  36.12 
 
 
298 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  39.46 
 
 
310 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  39.73 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  38.18 
 
 
312 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.18 
 
 
312 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  39.19 
 
 
334 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.18 
 
 
312 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 
306 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 
321 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 
321 aa  186  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.95 
 
 
306 aa  186  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  43.22 
 
 
309 aa  185  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 
312 aa  185  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  37.24 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 
342 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.62 
 
 
398 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 
321 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 
328 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.04 
 
 
313 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 
303 aa  182  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 
315 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  33.56 
 
 
312 aa  181  9.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  39.8 
 
 
305 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  40.14 
 
 
321 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 
356 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  38.58 
 
 
309 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 
340 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.4 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  37.27 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>