More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4666 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  100 
 
 		 320 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  60.81 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  58.67 
 
 		 329 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  59.51 
 
 		 328 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  57.1 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  61.62 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  54.26 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  54.26 
 
 		 333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  54.67 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  53.78 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  51.9 
 
 		 297 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  58.08 
 
 		 314 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  56.89 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  56.89 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  56.9 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  55.24 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  57.61 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  58.76 
 
 		 314 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  56.1 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  55.78 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  57.19 
 
 		 372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  51.78 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  57.04 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  57.29 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  51.36 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  47.45 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  51.06 
 
 		 337 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  51.83 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  54.71 
 
 		 329 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  58.48 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  52.3 
 
 		 324 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  47.85 
 
 		 307 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  49.84 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  47.35 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  53.74 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  48.84 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  54.27 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  52.43 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  52.92 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  42.91 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.12 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.12 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.12 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.8 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.76 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  38.44 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  38.44 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.1 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.1 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  40.74 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.95 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  40.82 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.14 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  41.14 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  40.37 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  42.52 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.07 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.14 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  38.33 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  36.73 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  35.09 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  37.93 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  39.41 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.96 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 		 307 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  39.84 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.71 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  38.03 
 
 		 306 aa  170  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  37 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  35.59 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  33.68 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  38.3 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  37.85 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.92 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  40.93 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.92 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.92 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  35.37 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  35.2 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>