More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0853 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  100 
 
 
306 aa  598  1e-170  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  58.75 
 
 
378 aa  340  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  49.13 
 
 
317 aa  267  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  48.11 
 
 
325 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  48.11 
 
 
325 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  42.38 
 
 
398 aa  245  8e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  45.08 
 
 
299 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
299 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  44.41 
 
 
299 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  44.07 
 
 
299 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.04 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  44.68 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.68 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  44.68 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  44.68 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  43.73 
 
 
299 aa  231  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  43.89 
 
 
359 aa  230  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
315 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.59 
 
 
342 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 
317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 
307 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  43.88 
 
 
301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 
301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 
301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  43.88 
 
 
301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  41.26 
 
 
315 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 
312 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  42.55 
 
 
305 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 
319 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 
319 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  36.24 
 
 
311 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  37.04 
 
 
312 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  37.04 
 
 
312 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 
340 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.97 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  37.04 
 
 
312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  40.45 
 
 
327 aa  188  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 
326 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 
327 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  37.33 
 
 
313 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  38.46 
 
 
312 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  40.81 
 
 
308 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1885  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 
343 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 
314 aa  185  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  37.99 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  37.94 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  38.27 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 
324 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  37.15 
 
 
299 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 
328 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.84 
 
 
304 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  37.19 
 
 
306 aa  181  1e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 
309 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.59 
 
 
298 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  34.68 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  42.32 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  38.3 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 
311 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.18 
 
 
342 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.51 
 
 
300 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 
300 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  39.49 
 
 
316 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  39.13 
 
 
316 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.27 
 
 
298 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  35.02 
 
 
312 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  40.35 
 
 
299 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 
321 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 
307 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 
342 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  38.03 
 
 
320 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 
316 aa  175  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  41.16 
 
 
316 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.19 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  37.21 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.42 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  37.18 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  37.21 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  37.21 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0032  cation efflux family protein  37.02 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  37.21 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 
334 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  36.68 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.95 
 
 
299 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  40.81 
 
 
306 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 
305 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 
297 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 
294 aa  169  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>