More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0594 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
314 aa  618  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  48.32 
 
 
321 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  41.52 
 
 
299 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  47.99 
 
 
334 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 
299 aa  254  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  41.18 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  41.52 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  48.75 
 
 
305 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  45.3 
 
 
307 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.52 
 
 
299 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.52 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.18 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.52 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 
342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  45.58 
 
 
305 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  41.18 
 
 
299 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  41.05 
 
 
295 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2655  cation diffusion facilitator family transporter  49.1 
 
 
333 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 
315 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  43.18 
 
 
347 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  49.82 
 
 
347 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  39.93 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  48.35 
 
 
313 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 
305 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 
326 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6562  cation efflux family protein  48.55 
 
 
317 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0134377 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 
312 aa  225  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 
316 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  45.49 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  46.15 
 
 
299 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
305 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  42.96 
 
 
305 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  42.34 
 
 
298 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  40.45 
 
 
326 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  42.81 
 
 
315 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  42.14 
 
 
298 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  41.64 
 
 
331 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  41.84 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.81 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 
300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  43.4 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  41.53 
 
 
312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  41.53 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  41.53 
 
 
312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  41.53 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  40.89 
 
 
312 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  41.53 
 
 
312 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  41.84 
 
 
325 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 
309 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  38.82 
 
 
398 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  47.23 
 
 
307 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.59 
 
 
304 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  42.16 
 
 
334 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  40.73 
 
 
340 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  43.69 
 
 
305 aa  208  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  47.12 
 
 
300 aa  208  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  43.63 
 
 
325 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  42.2 
 
 
312 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 
302 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  47.92 
 
 
300 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
352 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
298 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 
342 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 
308 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  40.7 
 
 
297 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 
314 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  43.75 
 
 
313 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  36.04 
 
 
313 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  43.75 
 
 
313 aa  202  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 
317 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  46.48 
 
 
306 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  39.05 
 
 
333 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.93 
 
 
312 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.93 
 
 
312 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  38.93 
 
 
312 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  43.4 
 
 
313 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  43.4 
 
 
313 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  43.4 
 
 
313 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  43.4 
 
 
313 aa  202  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  42.25 
 
 
340 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  41.84 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  43.06 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.17 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  42.24 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 
316 aa  200  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  41.26 
 
 
316 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 
325 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 
325 aa  200  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  40.69 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  42.72 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  41.02 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>