More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4544 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 356 aa  686    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  74.15 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  70.35 
 
 		 308 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  64.47 
 
 		 304 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  73.22 
 
 		 307 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  62.38 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  53.99 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  61.86 
 
 		 305 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  64.31 
 
 		 313 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  53.33 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  47.91 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  53.77 
 
 		 300 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  49.19 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  52.54 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  51.61 
 
 		 308 aa  252  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  47 
 
 		 312 aa  249  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  48.87 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  53.55 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  43.09 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  43.09 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  43.09 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  43.09 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  49.46 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  52.35 
 
 		 303 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 		 343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  44 
 
 		 299 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  44.08 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  39.86 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.85 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.53 
 
 		 299 aa  209  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  44.33 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  36.66 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.16 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.3 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.85 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  43.6 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.51 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  40.85 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  40.85 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  42.67 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  42.67 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  40.85 
 
 		 312 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.51 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.18 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  38.85 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  38.85 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.04 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  43.44 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.75 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.41 
 
 		 305 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 		 299 aa  195  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  40.7 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  41.35 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  48.37 
 
 		 247 aa  189  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  42.9 
 
 		 305 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  39.72 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  39.73 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  41.47 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  38.72 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  41.07 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  41.9 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  35.37 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  41.2 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  41.2 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  41.2 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  39.8 
 
 		 297 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.85 
 
 		 312 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  39.24 
 
 		 378 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  40.85 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  35.81 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  41.1 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  40.2 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  35.02 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 294 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  34.2 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>