More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2839 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  81 
 
 		 335 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  72 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  54.98 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  59.12 
 
 		 316 aa  323  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  50.34 
 
 		 297 aa  305  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  56.23 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  57.61 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  54.04 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  54.21 
 
 		 325 aa  292  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  55.4 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  57.19 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  56.12 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  56.68 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  53.15 
 
 		 309 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  52.84 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  52.84 
 
 		 322 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  55.32 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  55.2 
 
 		 339 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  55.23 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  56.32 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  56.58 
 
 		 318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  54.48 
 
 		 337 aa  271  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  49.83 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  51.84 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  55.23 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  47.67 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  50.88 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  45.8 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  54.36 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  48.25 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  50.17 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  51.2 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  50.35 
 
 		 373 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 		 309 aa  248  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  47.55 
 
 		 356 aa  241  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  46.37 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  51.6 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  46.02 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  41.01 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  39.86 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  39.42 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  35.96 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  35.96 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  37.37 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  40.23 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  35.96 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  35.15 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  37.37 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.1 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  37.02 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.84 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.33 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  35.15 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  35.15 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.49 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.27 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  35.31 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.45 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  34.66 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  36.36 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.08 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  38.06 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.33 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  34.51 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  34.51 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.79 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>