More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0911 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  48.58 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  42.41 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  42.02 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  41.64 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  41.44 
 
 		 300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  42.51 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  42.03 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  37.86 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  38.97 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  39.21 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  36.53 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  42.12 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 		 342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  36.15 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  41.78 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  35.9 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40.32 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  33.8 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  33.8 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 		 312 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.77 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 311 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  35.48 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.98 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  36.75 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  37.22 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  37.41 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.87 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.22 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  33.22 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.87 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.87 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  34.17 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  35.82 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  36.66 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  34.2 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.87 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  35.92 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.1 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  33.66 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  34.01 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  34.32 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  35.69 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  36.95 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  35.69 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  35.69 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  34.52 
 
 		 365 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  35.69 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3267  cation efflux system protein  33.1 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496954  normal  0.224541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  35.69 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  34.25 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  34.92 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  37.01 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  34.92 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  34.9 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  35.23 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  35.23 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>