More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3026 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 366 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  84.43 
 
 		 356 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  66.94 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  55.24 
 
 		 319 aa  329  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  55.27 
 
 		 332 aa  328  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  60.51 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  59.01 
 
 		 322 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  59.01 
 
 		 322 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  55.79 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  55.79 
 
 		 333 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  51.34 
 
 		 300 aa  308  6.999999999999999e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  51.57 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  54.88 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  54.26 
 
 		 309 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3052  cation diffusion facilitator family transporter  57.09 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  51.72 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  51.03 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  56.38 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  57.39 
 
 		 318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  53.85 
 
 		 337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  53.15 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0495  cation diffusion facilitator family transporter  53.61 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  54.21 
 
 		 339 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  57.72 
 
 		 329 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  55.36 
 
 		 313 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  47.49 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  54.06 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  55.05 
 
 		 320 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4665  cation diffusion facilitator family transporter  53.09 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  51.01 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4286  cation diffusion facilitator family transporter  54.79 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.0201024 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  48.64 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  54.87 
 
 		 346 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  49.13 
 
 		 329 aa  262  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  48.62 
 
 		 335 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3644  cation diffusion facilitator family transporter  51.2 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  45.21 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  45.97 
 
 		 307 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  48.94 
 
 		 316 aa  243  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  45.19 
 
 		 309 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 314 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  38.29 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  37.5 
 
 		 305 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  36.17 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  40.18 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  39.63 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.33 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  37.76 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.76 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.01 
 
 		 299 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 314 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.32 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 		 298 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 		 321 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.36 
 
 		 304 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  38.01 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  35.64 
 
 		 299 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  32.78 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  32.78 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  34.4 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.78 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  35.35 
 
 		 307 aa  169  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  37.92 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  33.84 
 
 		 295 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 316 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  32.44 
 
 		 299 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  34.8 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  32.79 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  34.53 
 
 		 310 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.31 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 295 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  40.08 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  41.02 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.76 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  33.11 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  36.49 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  35.31 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  34.87 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  33.99 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  35.32 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>