More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3080 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  100 
 
 		 310 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  89.1 
 
 		 321 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  76.12 
 
 		 316 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  69.67 
 
 		 312 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  69.67 
 
 		 312 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  69.67 
 
 		 312 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  68.85 
 
 		 312 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  65.71 
 
 		 312 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  65.4 
 
 		 312 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  65.4 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  65.4 
 
 		 312 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  65.4 
 
 		 312 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  66.78 
 
 		 313 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0853  zinc transporter ZitB  67.47 
 
 		 313 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287649  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2890  cation diffusion facilitator family transporter  67.13 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0806  zinc transporter ZitB  67.13 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0778  zinc transporter ZitB  67.13 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000446188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2910  zinc transporter ZitB  67.13 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248313  normal  0.320086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00705  zinc transporter ZitB  66.78 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0137871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00694  hypothetical protein  66.78 
 
 		 313 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0161088  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  49.32 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  47.6 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  48.43 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  45.48 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  49.3 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  49.3 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 310 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  43.9 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  44.67 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  43.21 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  42.56 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  42.86 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  43.55 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  43.55 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.55 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.55 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  43.55 
 
 		 299 aa  235  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  41.16 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  43.55 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  42.81 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  43.54 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  40.48 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  40.6 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.6 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  43.68 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  43.68 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.22 
 
 		 305 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 305 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  40.41 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  42.69 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.05 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  40.47 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  39.47 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.47 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  39.47 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  39.47 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  42.31 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  42.31 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  41.67 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  40.73 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.41 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  34.93 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  36.3 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 335 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  36.96 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  39.16 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.24 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 297 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 324 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  36.27 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  41.13 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  39.35 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  37.99 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  41.78 
 
 		 607 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  38.74 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>