More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25900 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 304 aa  593  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  66.34 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  63.57 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  68.2 
 
 		 305 aa  358  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  65.03 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  58.67 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  62.67 
 
 		 307 aa  326  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  65.91 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  60.47 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  54.01 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  52.19 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  52.6 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  46.38 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  49.51 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  43 
 
 		 299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  46.03 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  48.11 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  51.47 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 326 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  43 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  44.86 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.86 
 
 		 300 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.33 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  44.26 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.93 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.38 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  48.81 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  40.14 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  42.76 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  44.26 
 
 		 307 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  42.09 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  42.09 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  42.57 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  47.95 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.05 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.81 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.05 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.71 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.71 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  37.87 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  42 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  40 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  42.4 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  41.06 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 247 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  34.6 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  38.27 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.7 
 
 		 317 aa  175  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  33.56 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  38.63 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  36.93 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  40.8 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  40.65 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  32.11 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  40.27 
 
 		 342 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  34.71 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  36.68 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  35.53 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  38.27 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  38.44 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  39.59 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>