More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 313 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  65.91 
 
 		 304 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  66.24 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  69.42 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  66.55 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  67.85 
 
 		 305 aa  359  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  59.48 
 
 		 313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  55.02 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  61.69 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  50.66 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  55.74 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  55.63 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  52.27 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  46.39 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  48.88 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  45.48 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  46.33 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  46.74 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  48.12 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  42.11 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  45.61 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  50.32 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  45.7 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  45.27 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  43.62 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  42.19 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.29 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.31 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.64 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 305 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.49 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  43.99 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.13 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.13 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.79 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.79 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  43.73 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.13 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  40.97 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  40.97 
 
 		 316 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.91 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 		 305 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.23 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  38.61 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  38.61 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  38.61 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  41.4 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  42.31 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  35.11 
 
 		 298 aa  179  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  46.5 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  44.91 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  42.09 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  42.59 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  35.47 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  40.8 
 
 		 312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.15 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  37.11 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  34.34 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  38.8 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  37.17 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  37.91 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  41.72 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  39.87 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  37.23 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  37.55 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  40.47 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40.47 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  39.21 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  40.47 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40.47 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  38.33 
 
 		 378 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.13 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  38.83 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>