More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3334 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
305 aa  587  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  68.2 
 
 
304 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  63.31 
 
 
308 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  64.95 
 
 
340 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  59.67 
 
 
313 aa  354  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  63.64 
 
 
356 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  67.85 
 
 
313 aa  328  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  64.16 
 
 
307 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  58.42 
 
 
305 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  59.93 
 
 
308 aa  297  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  46.45 
 
 
308 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  46.95 
 
 
312 aa  255  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  55.52 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  46.43 
 
 
306 aa  245  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  52.48 
 
 
300 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  46.93 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  48.65 
 
 
306 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  47.08 
 
 
300 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 
343 aa  223  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  45.23 
 
 
305 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  49.16 
 
 
303 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
306 aa  209  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  38.49 
 
 
301 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
301 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
301 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 
301 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  42.95 
 
 
326 aa  205  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  37.21 
 
 
299 aa  205  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 
299 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 
300 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.52 
 
 
300 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  37.75 
 
 
299 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  37.42 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  43.84 
 
 
314 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  48.37 
 
 
313 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  40.2 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.89 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  40.59 
 
 
299 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  37.75 
 
 
299 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 
299 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  40.66 
 
 
302 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.7 
 
 
299 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.7 
 
 
299 aa  191  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.04 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.04 
 
 
299 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  42.03 
 
 
307 aa  188  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 
304 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
305 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
305 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  40.93 
 
 
305 aa  185  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.66 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  40.4 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  47.76 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  41.16 
 
 
307 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 
312 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  34.36 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  42.19 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 
299 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  39.8 
 
 
316 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  39.8 
 
 
316 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 
342 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  37.26 
 
 
305 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 
327 aa  175  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  39.27 
 
 
303 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 
342 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  41.33 
 
 
342 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  41.39 
 
 
305 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 
294 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 
398 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  38.46 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  32.79 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.64 
 
 
315 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  36.69 
 
 
312 aa  165  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  36.69 
 
 
312 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  36.69 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.46 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  34.15 
 
 
298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  41.36 
 
 
342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  37.5 
 
 
312 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  37.82 
 
 
312 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 
309 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  41.22 
 
 
319 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 
305 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 
298 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  28.91 
 
 
300 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  34.58 
 
 
301 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 
321 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  40 
 
 
316 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 
328 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
309 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  32.65 
 
 
317 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 
299 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 
322 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 
322 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>