More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4510 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4510  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 247 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  51.88 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  51.24 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  46.91 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  50.63 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  45.68 
 
 		 340 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  48.9 
 
 		 356 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  46.03 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  46.69 
 
 		 304 aa  191  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  48.71 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  52.27 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  45.87 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  43.67 
 
 		 305 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 306 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  52.3 
 
 		 307 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  47.76 
 
 		 305 aa  174  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  50.21 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.3 
 
 		 342 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  37.45 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  42.02 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  43.58 
 
 		 302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  41.6 
 
 		 307 aa  158  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  36.75 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  35.95 
 
 		 299 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  46.75 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.89 
 
 		 304 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  37.34 
 
 		 305 aa  151  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  38.03 
 
 		 326 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  36.95 
 
 		 316 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  37.82 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  40.26 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.29 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.61 
 
 		 327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  42.49 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  36.52 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.15 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  41.63 
 
 		 309 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.15 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.15 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.15 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  42.15 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  36.48 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  36.48 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  41.53 
 
 		 342 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  38.75 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  39.83 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.89 
 
 		 299 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  38.77 
 
 		 316 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  39.65 
 
 		 312 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  38.77 
 
 		 316 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  34.85 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  34.85 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  43.24 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  37.9 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  39.83 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.47 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 		 323 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  36.41 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  33.61 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.47 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.47 
 
 		 295 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 		 317 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.89 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  37.39 
 
 		 314 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.89 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.09 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.47 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  36.97 
 
 		 329 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  38.82 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  38.82 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.91 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  33.91 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  40.09 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  38.63 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3767  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.784386  normal  0.408109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  34.04 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4043  cation diffusion facilitator family transporter  36.91 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  38.79 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4374  cation diffusion facilitator family transporter  37.3 
 
 		 347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  36.48 
 
 		 373 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  30.4 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 		 333 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 366 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  29.66 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1257  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 335 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>