More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0669 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0669  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 343 aa  693    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0166  Co/Zn/Cd efflux system component protein  72.64 
 
 		 312 aa  455  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157738  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  50.68 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  50.51 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  52.08 
 
 		 308 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  46.42 
 
 		 313 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  45.21 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  44.48 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  46.39 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.761376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3334  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 		 305 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19860  cation diffusion facilitator family transporter  45.95 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163356  decreased coverage  0.00158825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  45.36 
 
 		 300 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  40.82 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2900  cation diffusion facilitator family transporter  45.21 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.726586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  41.69 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  34.6 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  34.92 
 
 		 305 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.56 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.5 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  43.29 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  40.14 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.9 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  34.69 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.01 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  34.35 
 
 		 299 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  38.97 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  34.64 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 		 299 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  35.83 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  33.67 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 		 398 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.2 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  34.88 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  34.94 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  34.94 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  34.57 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  34.2 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  35.09 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  35.44 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  35.44 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  35.41 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  34.83 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  33.98 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 301 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  31.36 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1042  cation efflux family protein  31.49 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0815398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2195  cation diffusion facilitator family transporter  32.93 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  33.23 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  30.56 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  33.21 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  33.04 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  34.26 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  32.99 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  32.99 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  32.99 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  31.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0506  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0495  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0517  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1735  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.912037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  32.76 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  35.15 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  32.84 
 
 		 378 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.63 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.63 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  34.64 
 
 		 312 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  29.93 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0572  cation diffusion facilitator family transporter  31.67 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  34.64 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  33.22 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  34.29 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  35.21 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  34.29 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>