More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0153 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0153  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0646969  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0922  cation efflux protein  40.85 
 
 
303 aa  202  6e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.134705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0770  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 
324 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.031653  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1796  Co/Zn/Cd efflux system component  32.87 
 
 
296 aa  178  9e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  34.16 
 
 
300 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0338  Co/Zn/Cd efflux system component  31.38 
 
 
305 aa  175  8e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.473186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0280  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 
291 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  33.9 
 
 
300 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  30.21 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1952  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 
298 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110398  normal  0.0228516 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.97 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1507  cation diffusion facilitator family transporter  32.36 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0924835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  31.42 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  29.41 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2440  cation diffusion facilitator family transporter  31.6 
 
 
365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516557  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 
325 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
314 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4476  cation diffusion facilitator family transporter  29.57 
 
 
312 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 
298 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
311 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3275  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 
302 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0220502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 
309 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 
309 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  32.29 
 
 
309 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 
342 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
321 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
321 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  25.61 
 
 
326 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3476  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 
328 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434563  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  30.85 
 
 
334 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
311 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  31.36 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  31.36 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  31.36 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0329  Co/Zn/Cd efflux system component  32.09 
 
 
294 aa  155  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000706414  hitchhiker  0.000000000000071766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  31.76 
 
 
326 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 
320 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 
305 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  30.22 
 
 
329 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1980  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  31.47 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 
339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  32.04 
 
 
298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 
337 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  32.39 
 
 
378 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2884  cation diffusion facilitator family transporter  29.11 
 
 
307 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  28.87 
 
 
320 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1122  cation diffusion facilitator family transporter  31.69 
 
 
317 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000327537  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 
327 aa  151  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
317 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 
324 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 
300 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 
319 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 
319 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1700  cation efflux system protein  33.91 
 
 
303 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 
295 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  30.95 
 
 
314 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.77 
 
 
304 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2795  hypothetical protein  32.75 
 
 
307 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2664  hypothetical protein  32.39 
 
 
307 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
325 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1178  cation efflux family protein  33.68 
 
 
316 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.349373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 
313 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1852  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.63223  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1297  cation efflux family protein  33.11 
 
 
316 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0606  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.337192  normal  0.025711 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0465  cation efflux family protein  30.8 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0259706  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  27.85 
 
 
314 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  30.53 
 
 
299 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  27.49 
 
 
314 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  29.47 
 
 
312 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 
373 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2807  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 
317 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 
325 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  34.02 
 
 
325 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
309 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 
341 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 
308 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  30.53 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3422  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  27.89 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  30.18 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
301 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
301 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  30.53 
 
 
313 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  31.69 
 
 
306 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>