More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1450 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  72.85 
 
 		 462 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  90.43 
 
 		 460 aa  769    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  74.72 
 
 		 478 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  76.1 
 
 		 460 aa  702    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  74.28 
 
 		 459 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 460 aa  902    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  75.66 
 
 		 460 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 474 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 479 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 460 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  34.87 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  36.9 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 483 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  36.85 
 
 		 481 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 466 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  37.64 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 488 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  29.13 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.49 
 
 		 311 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  30.98 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 327 aa  127  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  31.5 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.65 
 
 		 310 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  32.42 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  31.62 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  31.62 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.64 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  31.82 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  30.43 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  31.25 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  30.43 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  29.26 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  29.26 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.26 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 307 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  32.73 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  29.3 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 		 285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.8 
 
 		 311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 		 304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  30.64 
 
 		 297 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25.06 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  29.71 
 
 		 305 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  32.02 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.83 
 
 		 314 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 309 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  30.43 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  30.72 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  30.31 
 
 		 297 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.91 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  30.3 
 
 		 300 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  33.93 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.12 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.86 
 
 		 305 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 294 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  27.27 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.68 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 293 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.08 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  32.68 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  26.44 
 
 		 301 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  28.19 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  28.87 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 295 aa  103  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  28.18 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.1 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  30.41 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  28.68 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 296 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  29.33 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  30.66 
 
 		 325 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 289 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  29.84 
 
 		 289 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  25.17 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 296 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  28.12 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>