More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1199 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  66 
 
 
303 aa  358  5e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0374  cation diffusion facilitator family transporter  66.67 
 
 
303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1513  cation diffusion facilitator family transporter  41.91 
 
 
302 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  39.53 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 
395 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.71 
 
 
354 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  31.83 
 
 
337 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 
299 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  31.27 
 
 
325 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  30.77 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.52 
 
 
291 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 
318 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 
422 aa  113  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
300 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  30.31 
 
 
317 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  30.42 
 
 
389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.16 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 
297 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  29.43 
 
 
410 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  30.04 
 
 
401 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0069  cation efflux family protein  30.14 
 
 
318 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  30.63 
 
 
319 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  27.92 
 
 
381 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  26.64 
 
 
294 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  26.42 
 
 
393 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  28.63 
 
 
293 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  28.63 
 
 
293 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  28.63 
 
 
293 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  28.63 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  28.63 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  28.63 
 
 
296 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.21 
 
 
297 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  28.63 
 
 
293 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  28.63 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  28.07 
 
 
299 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
392 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6231  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
299 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
308 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  25.42 
 
 
393 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  25.36 
 
 
323 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.55 
 
 
297 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  28.63 
 
 
293 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 
382 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 
387 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 
385 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  31.52 
 
 
320 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  28.33 
 
 
331 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 
291 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  28.92 
 
 
380 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  28.92 
 
 
380 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 
297 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 
306 aa  102  9e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  26.19 
 
 
297 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  26.19 
 
 
298 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.19 
 
 
297 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  26.19 
 
 
297 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.19 
 
 
298 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  26.19 
 
 
298 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
423 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  23.95 
 
 
313 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 
382 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.49 
 
 
290 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  26.87 
 
 
293 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.9 
 
 
306 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  27.97 
 
 
385 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  29.7 
 
 
289 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  26.19 
 
 
298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 
307 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5170  cation efflux protein  30.93 
 
 
303 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
378 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.88 
 
 
378 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  26.99 
 
 
313 aa  100  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3385  cation efflux protein  27.39 
 
 
385 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  27.49 
 
 
298 aa  99  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  29.93 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  28.03 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2824  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 
385 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  27.3 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2526  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0324472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0191  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
384 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114126  hitchhiker  0.0000000345826 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.08 
 
 
311 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 
460 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  27.02 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  27.03 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 
404 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  26.03 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0196  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 
404 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.831911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  26.59 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  27.31 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>