More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1201 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  100 
 
 
460 aa  892    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  73.8 
 
 
478 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  74.67 
 
 
460 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  73.72 
 
 
462 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  72.63 
 
 
459 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  90.43 
 
 
460 aa  818    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  74.67 
 
 
460 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  42.38 
 
 
474 aa  349  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  40.79 
 
 
479 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  39.96 
 
 
460 aa  322  9.000000000000001e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  36.14 
 
 
460 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  34.18 
 
 
459 aa  274  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  36.62 
 
 
459 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  35.37 
 
 
483 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 
466 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  37.95 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 
488 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 
476 aa  173  6.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  32.18 
 
 
311 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.49 
 
 
311 aa  136  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  27.21 
 
 
450 aa  133  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  32.17 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  30.64 
 
 
307 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 
285 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
308 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
315 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
327 aa  124  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 
310 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  33.62 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  31.14 
 
 
311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.72 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  31.97 
 
 
305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 
300 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 
307 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  30.37 
 
 
300 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  30.37 
 
 
300 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  31.79 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  28.78 
 
 
300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  30.74 
 
 
298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  28.78 
 
 
300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  27.8 
 
 
300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  29.33 
 
 
300 aa  114  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  33.93 
 
 
315 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 
300 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  31.16 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 
305 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  28.87 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 
300 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 
300 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 
300 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.64 
 
 
300 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 
300 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 
300 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.64 
 
 
300 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.52 
 
 
302 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  31.23 
 
 
300 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.76 
 
 
302 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.1 
 
 
297 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  32.54 
 
 
304 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  31.88 
 
 
300 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.79 
 
 
314 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 
312 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 
315 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  31.87 
 
 
289 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  31.87 
 
 
289 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.38 
 
 
294 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
294 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  33.67 
 
 
315 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  25.89 
 
 
301 aa  106  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 
323 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.96 
 
 
354 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 
289 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 
278 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 
302 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  32.32 
 
 
305 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  26.52 
 
 
318 aa  103  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  29.49 
 
 
295 aa  103  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  29.66 
 
 
410 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  31.78 
 
 
300 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 
291 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  29.76 
 
 
297 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  31.35 
 
 
328 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  29.27 
 
 
293 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  29.89 
 
 
317 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28.91 
 
 
296 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  28.91 
 
 
296 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  29.37 
 
 
296 aa  99.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  28 
 
 
291 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 
396 aa  99.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
337 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  28.82 
 
 
290 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
315 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  32 
 
 
289 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>