More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2149 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  74.67 
 
 		 460 aa  636    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  85.65 
 
 		 478 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  81.7 
 
 		 460 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 460 aa  909    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  85.22 
 
 		 459 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  75.66 
 
 		 460 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  71 
 
 		 462 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 479 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 		 460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  36.2 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  36.29 
 
 		 459 aa  251  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  36.32 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 466 aa  232  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  32.21 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  29.94 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  34.13 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.03 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  34.77 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  28.9 
 
 		 301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  28.25 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  31.03 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  31.47 
 
 		 300 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 		 285 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.87 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  32.31 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  32.95 
 
 		 300 aa  124  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  32.95 
 
 		 300 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  31.11 
 
 		 300 aa  123  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  32.31 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.54 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  32.57 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.08 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  34.24 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  32.22 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  30.65 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  30.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.89 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  30.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  31.42 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  30.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  30.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  29.89 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  30.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  30.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  29.89 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  29.89 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  32.4 
 
 		 305 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  29.89 
 
 		 300 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  30.65 
 
 		 300 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.47 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 		 308 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.34 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.06 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.92 
 
 		 285 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 346 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30.25 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  29.56 
 
 		 298 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 305 aa  110  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 		 278 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  30.11 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.17 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  29.93 
 
 		 297 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  34.43 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 		 331 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 		 354 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.92 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  33.07 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  29.6 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 295 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 337 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  32.02 
 
 		 382 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  32.02 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  32.59 
 
 		 305 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  28.46 
 
 		 300 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4982  cation diffusion facilitator family transporter  30.86 
 
 		 307 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0279964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  32.63 
 
 		 300 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 310 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 297 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  31.33 
 
 		 289 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  31.71 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.1 
 
 		 306 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.47 
 
 		 317 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 		 306 aa  97.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1587  cation diffusion facilitator family transporter  29.74 
 
 		 307 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.697729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  29.73 
 
 		 395 aa  97.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  31.56 
 
 		 298 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>