More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0393 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 483 aa  952    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  60 
 
 		 481 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  44.19 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  47.59 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 476 aa  319  7e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  37.26 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  38.3 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  35.89 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  36.44 
 
 		 459 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  34.39 
 
 		 460 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  34.79 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  36.94 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  36.31 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 		 479 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  35.75 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  37.61 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  37.2 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  35.86 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  38.24 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  40.13 
 
 		 310 aa  176  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  36.67 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  35.12 
 
 		 311 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 317 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  35.12 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  38.82 
 
 		 327 aa  160  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 308 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  39.32 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  28.54 
 
 		 450 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  36.03 
 
 		 311 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  33.79 
 
 		 285 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 305 aa  153  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  25.88 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  36.42 
 
 		 314 aa  150  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 328 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  35.22 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 315 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  34.01 
 
 		 307 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 		 315 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.54 
 
 		 314 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 		 312 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 305 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  31.44 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 300 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 312 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  31.19 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  31.68 
 
 		 312 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  30.69 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  30.47 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  29.28 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  30.25 
 
 		 278 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  31.77 
 
 		 305 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  29.01 
 
 		 380 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 304 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.24 
 
 		 299 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.15 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 312 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  118  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  30.11 
 
 		 300 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  30.64 
 
 		 318 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  28.47 
 
 		 302 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  31.29 
 
 		 296 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 296 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  31.25 
 
 		 297 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  26.28 
 
 		 313 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  29.65 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  31.48 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  31.48 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  32.18 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.75 
 
 		 300 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 		 295 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  27.42 
 
 		 289 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.75 
 
 		 300 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  29.15 
 
 		 302 aa  113  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 381 aa  113  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>