More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3459 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 295 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  74.39 
 
 		 289 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  72.95 
 
 		 293 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  71.58 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  73.26 
 
 		 289 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  70.53 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  70.18 
 
 		 296 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  70.53 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  74.39 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  74.74 
 
 		 289 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  73.68 
 
 		 297 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  73.33 
 
 		 299 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  72.98 
 
 		 297 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  72.57 
 
 		 289 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  72.28 
 
 		 296 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  69.47 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  46.05 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  45.89 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  47.39 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  47.06 
 
 		 325 aa  258  9e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  46.98 
 
 		 300 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  48.42 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  46.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  46.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  46.42 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  46.24 
 
 		 300 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  47.2 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  46.77 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  46.79 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  47.04 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  47.2 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  45.64 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  44.14 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  44.06 
 
 		 300 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  46.18 
 
 		 290 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  47.04 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  46.53 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  45.3 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  43.71 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  43.71 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  45.45 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  44.76 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  46.21 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  46.4 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  42.46 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  45.36 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  45.45 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  45.36 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  45.68 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  44.6 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  45.83 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  40.58 
 
 		 296 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  37.33 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  39.13 
 
 		 323 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  33.09 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  31.07 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.23 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  34.62 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  31.65 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  28.21 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  29.09 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  32.5 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  30.96 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  28.79 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  30.9 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  29.5 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.29 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.37 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  32.62 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  33.83 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  30.68 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  28.98 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  32.44 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>