More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3430 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  77.51 
 
 
293 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  75.78 
 
 
296 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  75.43 
 
 
296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  75.43 
 
 
296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  76.12 
 
 
290 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  79.24 
 
 
299 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  78.55 
 
 
297 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  77.51 
 
 
297 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  74.74 
 
 
289 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  77.16 
 
 
296 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  74.74 
 
 
289 aa  427  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  75.09 
 
 
289 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  72.57 
 
 
295 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  70.93 
 
 
289 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  71.28 
 
 
289 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  48.45 
 
 
301 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  48.25 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  49.3 
 
 
301 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  48.39 
 
 
312 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  48.6 
 
 
300 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  47.33 
 
 
300 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  49.31 
 
 
298 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  49.3 
 
 
300 aa  258  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  48.25 
 
 
300 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  49.65 
 
 
317 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  48.25 
 
 
300 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  49.65 
 
 
300 aa  256  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  47.57 
 
 
297 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 
298 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  46.5 
 
 
302 aa  254  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  52.69 
 
 
289 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  48.3 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  47.72 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 
300 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 
300 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  46.88 
 
 
297 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 
300 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  47.55 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  50.35 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  47.55 
 
 
300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  46.15 
 
 
302 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 
300 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  48.95 
 
 
300 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  45.74 
 
 
325 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  50.9 
 
 
290 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  50.54 
 
 
290 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  46.88 
 
 
298 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  45.45 
 
 
298 aa  241  9e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  46.53 
 
 
298 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  46.45 
 
 
292 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  46.18 
 
 
293 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  47.84 
 
 
310 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  50.18 
 
 
290 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  43.48 
 
 
296 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 
325 aa  195  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 
308 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  40.81 
 
 
312 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  38.77 
 
 
323 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 
299 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  33.21 
 
 
297 aa  155  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  35.25 
 
 
314 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  34.4 
 
 
311 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  29.29 
 
 
295 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  29.29 
 
 
295 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  28.57 
 
 
295 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  32.01 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  31.12 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  32.14 
 
 
304 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  31.29 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  33.46 
 
 
291 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.31 
 
 
285 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 
308 aa  125  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
304 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  30.25 
 
 
289 aa  125  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 
307 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.78 
 
 
311 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  29.02 
 
 
305 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 
295 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 
311 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  26.89 
 
 
459 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.18 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  30.22 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 
460 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  29.58 
 
 
307 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  29.68 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  28.62 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>