More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0484 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  52.41 
 
 		 302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  50.34 
 
 		 301 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  51.03 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  49.49 
 
 		 300 aa  292  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  49.49 
 
 		 300 aa  292  6e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  47.32 
 
 		 300 aa  291  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  49.66 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  49.15 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  48.47 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  50.55 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  50 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  47.4 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  50.18 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  47.12 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  47.1 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  47.1 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  47.1 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  50.69 
 
 		 300 aa  278  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  48.97 
 
 		 300 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  46.42 
 
 		 300 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  46.13 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 296 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  46.1 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  44.64 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  46.35 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  46.35 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  44.68 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  44.25 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  42.91 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  45.45 
 
 		 289 aa  241  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  41.81 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  44.98 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 297 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  41.11 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  44.33 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  40.77 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  43.07 
 
 		 298 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  44.68 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  42.96 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  45.62 
 
 		 290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  43.17 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  45.71 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  41.13 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  37.91 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  37.23 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  34.64 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  34.64 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  35 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  33.21 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  32.75 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  32.99 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  34.84 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  31.79 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.32 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 309 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  36.68 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.38 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  34.05 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  31.58 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  29.02 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.96 
 
 		 323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  31.83 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  30.56 
 
 		 376 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  29.64 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  27.84 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  29.33 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  28.27 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  29.77 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.88 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  28.52 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>