More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0896 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  100 
 
 		 304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  64.41 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  63.39 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  63.39 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  48.8 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  47.33 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  44.64 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  51.4 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  47.06 
 
 		 289 aa  242  7e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  36.33 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  34.23 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  34.29 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  34.48 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  32.65 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  31.54 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.54 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  31.8 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  32.21 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  32.38 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  32.38 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  32.38 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 301 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  32.38 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  30.91 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  30.86 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  32.03 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  33.68 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  34.03 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  30.14 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  30.1 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  31.64 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  30.45 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  31.64 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  31.64 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  32.28 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.43 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.08 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  31.38 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  33.57 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.14 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  32.14 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  30.03 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  32.98 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.29 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  29.24 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  31.79 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  30.21 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  32.86 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  31.64 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  32.52 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  28.17 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  32.51 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  29.78 
 
 		 327 aa  119  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  26.4 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  29.72 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  25.17 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  26.91 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  25 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  25.34 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  29.59 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  26.58 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  26.81 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  26.39 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>