More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1177 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  47.69 
 
 		 312 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  45.02 
 
 		 317 aa  244  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  46.26 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  45.64 
 
 		 302 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.3 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  41.18 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  43.56 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  42.31 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  44.27 
 
 		 298 aa  225  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  43.57 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  41.79 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  41.26 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  42.18 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  41.26 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  41.26 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  41.43 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  43.57 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  44.29 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  43.21 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  40.91 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  43.38 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  40.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  40.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  40.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  40.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  40.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  40.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  39.71 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  40.56 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  43.02 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  43.02 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  40.56 
 
 		 300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  42.53 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  42.64 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  42.01 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  40.07 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  40.71 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  41.34 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  43.32 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  41.64 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  38.21 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  39.71 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  38.6 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  37.88 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  39.36 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  39.01 
 
 		 290 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  38.57 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  40.78 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  38.97 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  36.9 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  40.43 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  39.34 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  33.1 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  30.39 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  30.04 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  30.04 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.3 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  31.51 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  32.01 
 
 		 460 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  28.72 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  31.06 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  28.57 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  28.86 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  30.99 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  27.11 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.16 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 481 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  29.49 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 		 459 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  28.66 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  29.64 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  31.29 
 
 		 459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  26.95 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  29.62 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  34.05 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  27.8 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  31.9 
 
 		 483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>