More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1215 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 302 aa  583  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  70.81 
 
 		 305 aa  422  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  69.67 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  70.81 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 		 476 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  39.07 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  36.45 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 		 481 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  35.25 
 
 		 483 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 		 466 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  37.58 
 
 		 450 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  34.44 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  27.95 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  31.39 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.27 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  30.26 
 
 		 450 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  30.07 
 
 		 460 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  32.45 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  34.75 
 
 		 488 aa  122  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.12 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.95 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  31.08 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  29.86 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  33 
 
 		 307 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  29.07 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  32.85 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  31.29 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31.53 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  31.79 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  30.45 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.82 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.14 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  32.42 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  31.43 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  31.43 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  31.43 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  32.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  32.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  34.93 
 
 		 462 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  32.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  32.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  31.43 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  33.78 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  32.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  32.5 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  31.43 
 
 		 460 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  32.14 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  32.11 
 
 		 478 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  31.58 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  32.51 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30.28 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.13 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  29.23 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  31.25 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  29.83 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  30.72 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  31.77 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  29.82 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  27.59 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.86 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  30.69 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.94 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  28.57 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  29.29 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  31.14 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  31.21 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  29.14 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  25.27 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.01 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  30.77 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  30.77 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  32.7 
 
 		 474 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1119  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.194456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  31.09 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  29.63 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  30.42 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  30.2 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  29.79 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>