More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1891 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1891  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
314 aa  617  1e-176  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0381749 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0125  cation diffusion facilitator family transporter  75.39 
 
 
317 aa  496  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2239  cation diffusion facilitator family transporter  75.09 
 
 
305 aa  441  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.482091  normal  0.467458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1215  cation diffusion facilitator family transporter  70.81 
 
 
302 aa  395  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
466 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
476 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  34.01 
 
 
481 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 
483 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 
310 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  34.28 
 
 
307 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  30.94 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  31.19 
 
 
296 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  36.56 
 
 
450 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  34.93 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  34.87 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  30.58 
 
 
459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  31.65 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  32.62 
 
 
297 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  32.26 
 
 
297 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  35 
 
 
298 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.18 
 
 
302 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.22 
 
 
311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 
460 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 
323 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  30.77 
 
 
302 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 
450 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.14 
 
 
285 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.7 
 
 
307 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  32.53 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  30.45 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.48 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  33.68 
 
 
295 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  29.72 
 
 
302 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.63 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 
289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  26.95 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  32.14 
 
 
290 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  31.79 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  30.24 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  30.8 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  29.45 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  32.86 
 
 
300 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  30.33 
 
 
299 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
296 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  29.69 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  30.22 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  30.55 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.18 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  31.9 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  31.41 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  30.2 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  29.67 
 
 
300 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  31.47 
 
 
293 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  30.27 
 
 
299 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  30.56 
 
 
295 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  28 
 
 
300 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
295 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1366  cation diffusion facilitator family transporter  30.88 
 
 
422 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  29.19 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  29.82 
 
 
300 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 
299 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  29.82 
 
 
300 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.82 
 
 
300 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  29.2 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  32.49 
 
 
459 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  29.87 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  30.18 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  29.96 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  29.8 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  31.05 
 
 
300 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 
300 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  31.05 
 
 
300 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  29.24 
 
 
289 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  31.05 
 
 
300 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  31.05 
 
 
300 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  31.05 
 
 
300 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  31.05 
 
 
300 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  31.64 
 
 
300 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  31.64 
 
 
300 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  31.05 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 
354 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  29.72 
 
 
296 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  30.69 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 
460 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  30.29 
 
 
302 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  28.47 
 
 
292 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  26.84 
 
 
306 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  28.47 
 
 
313 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  30.24 
 
 
300 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 
309 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
289 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>