More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0900 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  31.58 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  33.45 
 
 
296 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  32.03 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  31.58 
 
 
299 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
299 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
299 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 
299 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 
300 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 
297 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  33.45 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.45 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  33.45 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  33.11 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  33.45 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  33.45 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  33.45 
 
 
298 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 
293 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  33.11 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  32.76 
 
 
297 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
323 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
297 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 
291 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
290 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  28.52 
 
 
291 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1700  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 
293 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0634  cation efflux family protein  29.66 
 
 
314 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  31.02 
 
 
293 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  31.02 
 
 
293 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  31.93 
 
 
289 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 
313 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2418  cation efflux family protein  30.66 
 
 
293 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  30.66 
 
 
296 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  30.66 
 
 
296 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  30.66 
 
 
296 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  30.66 
 
 
293 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  30.66 
 
 
296 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  30.66 
 
 
293 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  30.28 
 
 
299 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  29.25 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.33 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2127  cation diffusion facilitator family transporter  31.02 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  31.58 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  29.23 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  31.94 
 
 
291 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  29.26 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  28.92 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  27.11 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  28.87 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  28.87 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
354 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1992  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1410  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1861  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.350904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 
401 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  28.26 
 
 
294 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  27.64 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 
409 aa  126  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 
387 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 
285 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  31.22 
 
 
393 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  27.47 
 
 
294 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  27.82 
 
 
411 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  30.77 
 
 
393 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  27.3 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  27.56 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  28.22 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1712  cation diffusion facilitator family transporter  30.15 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00125134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2423  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  26.47 
 
 
389 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.3 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1437  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.72 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.929913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2381  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000223883  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0553  cation diffusion facilitator family transporter  24.91 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  24.46 
 
 
293 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25.18 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0344  cation transporter  28.47 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45119  predicted protein  30.38 
 
 
591 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  25.87 
 
 
332 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  26.49 
 
 
381 aa  112  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1188  cation diffusion facilitator family transporter  24.04 
 
 
322 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0282  cation diffusion facilitator family transporter  25.7 
 
 
385 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0264  cation diffusion facilitator family transporter  25.7 
 
 
385 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  23.69 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0698  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 
406 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  24.15 
 
 
295 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1517  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 
378 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1450  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.46 
 
 
378 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.59644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 
298 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  24.55 
 
 
299 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  23.38 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0210  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
404 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>