More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1143 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  100 
 
 		 331 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  60.43 
 
 		 331 aa  421  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  60.43 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  46.42 
 
 		 327 aa  332  8e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  42.12 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  39.7 
 
 		 337 aa  265  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  39.18 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  37.65 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 304 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  29.8 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  35.32 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  34.18 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  35.56 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  35.22 
 
 		 296 aa  156  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  35.46 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  38.37 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  36.15 
 
 		 295 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.48 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  32.45 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.76 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 		 295 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  33.98 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  34.27 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  26.1 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  35.1 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  35.36 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  35.66 
 
 		 295 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  34.78 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  33.85 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.2 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  32.19 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  32.25 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  33.61 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  35.18 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  35.34 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  33.6 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  31.47 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  34.73 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  31.95 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  30.22 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  27.83 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  31.05 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  34.31 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  35.6 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  31.8 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  30.08 
 
 		 332 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  33.91 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.8 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  34.8 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  31.64 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  31.64 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  33.6 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  30.42 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  33.95 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  30.12 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  35.6 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25.59 
 
 		 460 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  24.31 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  27.05 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  26.47 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.33 
 
 		 299 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  29.61 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  27.13 
 
 		 481 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  23.58 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.57 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  30.28 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  26.95 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  27.42 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>