41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3985 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  100 
 
 		 319 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  87.15 
 
 		 319 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  86.21 
 
 		 319 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  86.21 
 
 		 319 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  71.29 
 
 		 317 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  65.15 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  59.01 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  60.71 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  56.31 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  50.16 
 
 		 370 aa  328  8e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  46.05 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  40.92 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  39.93 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  41.88 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  39.74 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  39.94 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  37.7 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  34.75 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.84 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  27.53 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  23.64 
 
 		 268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  29.43 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  25.86 
 
 		 257 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  30.81 
 
 		 227 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  25.57 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  26.01 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  27.05 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  22.27 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  23.61 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  20.83 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  23.75 
 
 		 315 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  24.72 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  25.12 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>