51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2240 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
326 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  32.67 
 
 
323 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 
307 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  29.37 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  29.04 
 
 
312 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 
308 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  27.78 
 
 
319 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  26.47 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  26.47 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  26.13 
 
 
319 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  27.18 
 
 
317 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  24.66 
 
 
303 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  24.66 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  28.87 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  25.08 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  25.49 
 
 
308 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 
305 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  27.15 
 
 
301 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  27.09 
 
 
300 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  23.86 
 
 
341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  30.36 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  23.31 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  24.53 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  23.84 
 
 
299 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  27.67 
 
 
320 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 
370 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  26.85 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  26.84 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  27.95 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  26.83 
 
 
227 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  23.77 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  29.81 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  27 
 
 
304 aa  57  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.93 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  22.03 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  21.99 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1146  cation efflux family protein  25.22 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00680044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.19 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  26.46 
 
 
291 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.74 
 
 
312 aa  46.2  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  21.3 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  25.12 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  23.19 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1954  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000254131  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  21.7 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  21.19 
 
 
293 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  21.19 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  21.19 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  21.19 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  21.19 
 
 
296 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>