33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1043 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.41 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  43.69 
 
 		 257 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  47 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  41.75 
 
 		 317 aa  138  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  37.1 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 299 aa  121  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  28.44 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  28.44 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  29.19 
 
 		 327 aa  99.4  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  26.36 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  28.11 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  30.81 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  28.11 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  31.28 
 
 		 319 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  31.28 
 
 		 319 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  27.81 
 
 		 301 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  30.81 
 
 		 319 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  27.49 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 		 326 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  25.47 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  22.43 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  26.77 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  26.32 
 
 		 341 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  26.6 
 
 		 370 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  25.59 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 308 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  21.54 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  25.13 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>