86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0350 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  45.97 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  41.88 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  41.56 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  41.88 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  41.23 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  41.23 
 
 		 319 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  39.94 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  40.26 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  39.56 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2130  cation efflux protein  38.61 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.052432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  40.79 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  37.07 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0225  cation diffusion facilitator family transporter  36.81 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0856806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1226  cation diffusion facilitator family transporter  30.92 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  35.84 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  28.72 
 
 		 299 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  30.1 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  28.2 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  27.48 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0337  cation efflux protein  34.51 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  27.4 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05417  hypothetical protein  24.32 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001476  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  23.99 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  26.77 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  24.64 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  25.24 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3015  cation diffusion facilitator family transporter  26.41 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3105  cation diffusion facilitator family transporter  26.41 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  27.89 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  27.67 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1554  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1615  cation transporter, permease component  20.63 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0151047  normal  0.0448748 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 460 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  24.5 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  23.94 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 459 aa  49.7  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  24.39 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  20.17 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  23.84 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  21.09 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  23.94 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  22.01 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1040  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 388 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  21.52 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  25.77 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  25.81 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0532  ferrous-iron efflux pump FieF  24.26 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.800383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2356  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 		 409 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.868825  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  26.67 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  22.36 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  29.46 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  25.29 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  20.81 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0570  cation diffusion facilitator family transporter  23.89 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.712384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  23.21 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  20 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3463  cation diffusion facilitator family transporter  25.65 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  21.13 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  23.94 
 
 		 483 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  25 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2027  cation diffusion facilitator family transporter  24.22 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  24.05 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02030  Co/Zn/Cd efflux system component  28.38 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.434455  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  22.96 
 
 		 380 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1967  cation diffusion facilitator family transporter  27.03 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  22.79 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>