89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14660 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  100 
 
 		 215 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  63.68 
 
 		 240 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  63.24 
 
 		 328 aa  251  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  65.66 
 
 		 229 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  62.63 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  64.76 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  59.71 
 
 		 296 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  70.81 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  65.66 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  61.11 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  62.68 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  61.95 
 
 		 257 aa  224  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  64.14 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  61.34 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  62 
 
 		 238 aa  208  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  63.64 
 
 		 229 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  63.64 
 
 		 229 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  63.64 
 
 		 229 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  40.09 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  40.09 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  35.18 
 
 		 213 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  41.97 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  40.21 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  44.33 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  38.1 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  31.73 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.91 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.83 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  34.29 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.91 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  34.02 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  33.8 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.92 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.47 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.1 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  29.76 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  24.55 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  20.42 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  27.23 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  23.47 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  25.76 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24.57 
 
 		 306 aa  52  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  26.15 
 
 		 297 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 306 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  25.79 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  29.88 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  27.22 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.81 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  25.95 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  21.65 
 
 		 313 aa  48.9  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  23.59 
 
 		 297 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.1 
 
 		 297 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  24.1 
 
 		 297 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  24.1 
 
 		 298 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  24.1 
 
 		 298 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  24.1 
 
 		 298 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  23.59 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  24.88 
 
 		 289 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  21.76 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  24.74 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 299 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  24.39 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  25.71 
 
 		 289 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 		 289 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 		 328 aa  45.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  27.01 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  30.12 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.27 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  22.11 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  22.97 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  19.7 
 
 		 393 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  19.7 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  26.74 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  27.87 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  26.29 
 
 		 307 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  25.13 
 
 		 346 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  25.89 
 
 		 401 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1043  putative cation efflux pump  25.13 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  25.27 
 
 		 299 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  22.4 
 
 		 294 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 312 aa  42  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 		 304 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  23.65 
 
 		 293 aa  42.4  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  26.23 
 
 		 339 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  21.83 
 
 		 289 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  24.27 
 
 		 308 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  24.59 
 
 		 474 aa  41.6  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0339  cation diffusion facilitator family transporter  23.12 
 
 		 293 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000143188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>