84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1729 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  100 
 
 		 221 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  71.11 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  73.3 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  71.49 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  63.43 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  57.14 
 
 		 328 aa  234  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  57.6 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  60.93 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  64 
 
 		 229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  62.56 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  66.67 
 
 		 256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  58.59 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  59.56 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  56.84 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  62.16 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  62.16 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  62.16 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  62.62 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  46.34 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  46.34 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  45.24 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  38.12 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  42.57 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  36.32 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  40.19 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  32.57 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  37.02 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  33.5 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.41 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  34.8 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  33.8 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  31.47 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.21 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.16 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  31.21 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  27.33 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  24.73 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  24.2 
 
 		 302 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  23.66 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.96 
 
 		 317 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 		 299 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  27.56 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  26.21 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 308 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  21.39 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  22.17 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  26.02 
 
 		 312 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  24.24 
 
 		 314 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.57 
 
 		 299 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  25.81 
 
 		 311 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  24.49 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  25.15 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  35.8 
 
 		 296 aa  45.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  21.2 
 
 		 312 aa  45.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  32.28 
 
 		 460 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  30.97 
 
 		 339 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  21.5 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  26.24 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 306 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 312 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  23.56 
 
 		 299 aa  45.1  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 306 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  23.56 
 
 		 411 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  27.72 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0625  cation diffusion facilitator family transporter  24.42 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  21.43 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  23.3 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0465  cation efflux family protein  24.42 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.326406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  31.36 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  23.74 
 
 		 307 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  29.69 
 
 		 326 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  21.39 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  20.92 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  22.56 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  29.03 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  28.9 
 
 		 332 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 310 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23.28 
 
 		 291 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  28.07 
 
 		 319 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  23.03 
 
 		 320 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>