44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0515 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  86.47 
 
 		 219 aa  328  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  67.63 
 
 		 216 aa  288  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  66.2 
 
 		 218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  69.39 
 
 		 211 aa  271  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  66.84 
 
 		 211 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  54.68 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  57 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  36.92 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  36.92 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  36.36 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  31.6 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  34.29 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  41.14 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35.91 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  34.18 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  39.3 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  33.65 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  33.16 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  29.9 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  33.63 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  32.29 
 
 		 296 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  31.63 
 
 		 328 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  33.04 
 
 		 238 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  31.43 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  33.8 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  32.09 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  36.28 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  36.28 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  36.28 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  35.23 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.34 
 
 		 243 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  31.53 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  30.23 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  27.69 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  28 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  27.62 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 		 323 aa  49.3  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  27.36 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  27.36 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  32.1 
 
 		 410 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  30.3 
 
 		 306 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 		 411 aa  41.6  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 		 307 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>