40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7650 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  100 
 
 		 207 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  50.47 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  50.25 
 
 		 222 aa  177  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  43.3 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  41.97 
 
 		 215 aa  130  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  40.62 
 
 		 328 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  43.65 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  39.38 
 
 		 240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  41.75 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  42.57 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  37.37 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  40.31 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  39.18 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  44.65 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  38.58 
 
 		 257 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  33.01 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  33.01 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  42.71 
 
 		 256 aa  101  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  44.03 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  41.45 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  41.45 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  41.45 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  37.5 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  35.35 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  31.86 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  32.82 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.99 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  31.19 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  28.88 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  27 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.53 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  28.5 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  25.74 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  29.53 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  28.93 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  22.89 
 
 		 288 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  22.89 
 
 		 288 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.63 
 
 		 306 aa  41.6  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>