37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3635 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  100 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  59.71 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  51.89 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  36.04 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  38.57 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  37.37 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  35.74 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  36.55 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  40.87 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  33.5 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  37.5 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  32.02 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  32.02 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  37.69 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  35.96 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  33.17 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  34.16 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  30.61 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35.2 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  30.85 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  33.67 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  34.69 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  34.98 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  34.98 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  34.98 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  31.94 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  27.7 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  27 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  26.22 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  29.72 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  30.5 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  28 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  27.23 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  26.85 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  27.54 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  30.14 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  27.05 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>