33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13300 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  100 
 
 		 222 aa  427  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  59.71 
 
 		 238 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  50.25 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  40.21 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  38.19 
 
 		 328 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  35.57 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  33.49 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  36.32 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  36.59 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  34.9 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  38.86 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  35.94 
 
 		 257 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  37.68 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  32.68 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  40 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  37.11 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  36.98 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  36.98 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  36.98 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  37.5 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  32.11 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  28.64 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  32.18 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  26.94 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  25.14 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  26.7 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.17 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  28.48 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1051  putative cation efflux system protein  24 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  28.96 
 
 		 315 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  28.08 
 
 		 216 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>