88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3905 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  416  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  416  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  86.27 
 
 
216 aa  320  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  46.34 
 
 
221 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  43.69 
 
 
240 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  41.67 
 
 
328 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  43 
 
 
232 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  40.09 
 
 
215 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  42.03 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  43.01 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  41.58 
 
 
229 aa  138  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  41.29 
 
 
202 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  44.78 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  43.3 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  36.36 
 
 
296 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  38.97 
 
 
257 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  38.46 
 
 
241 aa  121  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  40.82 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  34.76 
 
 
213 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  39.71 
 
 
229 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  39.71 
 
 
229 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  39.71 
 
 
229 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  35.08 
 
 
217 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  37.37 
 
 
235 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  36.92 
 
 
222 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  36.87 
 
 
219 aa  102  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  33.01 
 
 
207 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  30 
 
 
222 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  32.34 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  36.55 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.16 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  30.41 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.63 
 
 
211 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.45 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.59 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.33 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  25.51 
 
 
311 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  26.53 
 
 
311 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  31.03 
 
 
312 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 
305 aa  58.2  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
313 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  27.22 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  28.71 
 
 
312 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  27.18 
 
 
308 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 
299 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  32.16 
 
 
460 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  30.33 
 
 
307 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  25 
 
 
311 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.96 
 
 
312 aa  48.9  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  24.26 
 
 
290 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.63 
 
 
306 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  28.05 
 
 
411 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  24.5 
 
 
299 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  27.86 
 
 
297 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  27.86 
 
 
298 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.51 
 
 
291 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  21.15 
 
 
306 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  23.23 
 
 
299 aa  45.1  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 
291 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  27.14 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  27.14 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.14 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.14 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  27.14 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  23.66 
 
 
293 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  24.06 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  24.06 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.15 
 
 
297 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  23.12 
 
 
299 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2184  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 
303 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3033  cation efflux family protein  28.19 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2089  cation efflux protein  28.19 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2334  cation efflux family protein  28.19 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2291  cation efflux family protein  28.19 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2155  cation efflux family protein  28.19 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.112799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2093  cation efflux protein  28.19 
 
 
296 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0345856  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2310  cation efflux family protein  28.19 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  27.15 
 
 
297 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 
328 aa  42  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 
381 aa  42  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1162  cation diffusion facilitator family transporter  28.1 
 
 
266 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355876  normal  0.529733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  29.88 
 
 
459 aa  42  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19860  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 
362 aa  42  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.531716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  28.57 
 
 
320 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2343  cation efflux family protein  27.52 
 
 
293 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  25.4 
 
 
292 aa  41.6  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>