65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0423 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  100 
 
 
216 aa  414  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  86.47 
 
 
214 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  86.47 
 
 
214 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  45.5 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  42.23 
 
 
328 aa  141  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  43.5 
 
 
215 aa  138  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  42.11 
 
 
240 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  43.88 
 
 
240 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  43.15 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  43.15 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  44.85 
 
 
256 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  40.93 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  42.27 
 
 
243 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  36.92 
 
 
296 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  39.13 
 
 
202 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  39.9 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  33.51 
 
 
217 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  42.05 
 
 
238 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  33.15 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  38.92 
 
 
241 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  35.35 
 
 
207 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  32.84 
 
 
238 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  38.74 
 
 
219 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  40.38 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  40.38 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  40.38 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35.44 
 
 
235 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.57 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.74 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  32.47 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  28.64 
 
 
222 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.99 
 
 
218 aa  85.1  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.85 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.73 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  33.66 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  27.41 
 
 
311 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1026  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 
323 aa  58.5  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
311 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.32 
 
 
313 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  28.16 
 
 
299 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.5 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  25.25 
 
 
390 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.16 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.88 
 
 
306 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  26.4 
 
 
311 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 
293 aa  52  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  31.96 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.29 
 
 
306 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  25.65 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  21.76 
 
 
312 aa  48.5  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0399  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 
284 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00682032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  31.47 
 
 
307 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0383  cation diffusion facilitator family transporter  25.26 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.88 
 
 
299 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 
290 aa  45.8  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  26.34 
 
 
302 aa  45.4  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 
312 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  27.17 
 
 
318 aa  45.1  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  24.59 
 
 
289 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  26.67 
 
 
299 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  25.29 
 
 
299 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  24.59 
 
 
289 aa  42  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  38.36 
 
 
387 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0858  cation efflux system protein  27.08 
 
 
331 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>