46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3938 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  69.46 
 
 		 328 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  69.8 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  66.67 
 
 		 296 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  74 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  74 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  74 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  69.74 
 
 		 229 aa  250  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  69.35 
 
 		 257 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  68.53 
 
 		 241 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  71.79 
 
 		 243 aa  232  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  66.16 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  61.11 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  58.5 
 
 		 240 aa  216  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  62.63 
 
 		 232 aa  205  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  58.59 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  62.31 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  61.31 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  37.88 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  41.29 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  41.29 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  41.75 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  39.13 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  34.65 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  37.32 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  34.9 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  34.97 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.98 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  38.55 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  35.2 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  32.6 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.47 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  34.65 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.74 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.16 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.33 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  32.34 
 
 		 308 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 		 311 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 401 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  26.72 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  31.06 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  28.85 
 
 		 311 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  27.4 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  36.17 
 
 		 308 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 332 aa  41.6  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  30 
 
 		 312 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>