128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11683 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  100 
 
 		 213 aa  423  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  41.21 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  41.38 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  40.31 
 
 		 328 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  35.18 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  37.88 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  39.79 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  39.3 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  36.73 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  42.93 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  38.12 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  41.21 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  39.5 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  42.31 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  42.31 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  42.31 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  36.97 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  36.32 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  34.76 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  34.76 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  37.99 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  36.87 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  32.8 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  32.82 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  35.6 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.08 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.85 
 
 		 218 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.85 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  31.07 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  28.36 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  29.85 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  30.19 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  32.2 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  26.94 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  27.55 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.7 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  28.14 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  30.65 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  24.58 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.79 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  22.66 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  22.89 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  22.39 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.17 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  22.39 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  22.39 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  22.17 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  22.66 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  22.17 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  23.15 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  23.76 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  23.86 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  25.97 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  25.71 
 
 		 306 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  32.77 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  22.05 
 
 		 401 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  33.04 
 
 		 303 aa  52  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  27.08 
 
 		 306 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  21.81 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  25.39 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  26.82 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  23.43 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  26.06 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  29.36 
 
 		 304 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  22.8 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  27.35 
 
 		 396 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  29.45 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  26.92 
 
 		 318 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  23.35 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11850  cation diffusion facilitator family transporter  29.52 
 
 		 312 aa  48.9  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  23.98 
 
 		 312 aa  48.5  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  26.26 
 
 		 289 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 301 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4538  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 307 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1220  cation efflux family protein  30.77 
 
 		 376 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  24.26 
 
 		 308 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  22.28 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  23.89 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  27.33 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3649  cation efflux system protein  28.09 
 
 		 384 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.29953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  21.05 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  37.18 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  29.17 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 312 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  27.52 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  24.44 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  22.96 
 
 		 313 aa  45.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  21.78 
 
 		 300 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2613  cation efflux family protein  25.37 
 
 		 296 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  27.96 
 
 		 293 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  25.58 
 
 		 380 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  24.32 
 
 		 320 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  23.67 
 
 		 308 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  22.83 
 
 		 299 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  25.5 
 
 		 307 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0900  cation diffusion facilitator family transporter  20.65 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000200254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>