87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5392 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  70.31 
 
 		 221 aa  298  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  70.31 
 
 		 235 aa  286  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  71.62 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  62.63 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  55.37 
 
 		 328 aa  248  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  53.75 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  54.27 
 
 		 296 aa  238  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  56.96 
 
 		 257 aa  234  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  58.5 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  61.31 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  58.15 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  57.49 
 
 		 243 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  62.15 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  62.15 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  62.15 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  57.83 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  57.99 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  43.69 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  43.69 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  41.83 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  36.97 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  40.31 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  32.44 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  38.05 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  32.68 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.97 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  35.47 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35.47 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  33.63 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.54 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  32.88 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  29.23 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.16 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  34.36 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  35.42 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  31.86 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  24.58 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.37 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  29.12 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  32.31 
 
 		 460 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 299 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  24 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  29.12 
 
 		 297 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  28.02 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  28.02 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  28.02 
 
 		 298 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  27.91 
 
 		 302 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  27.47 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  27.47 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.47 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.47 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  27.47 
 
 		 298 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  23.53 
 
 		 306 aa  49.3  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  22.67 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  26.92 
 
 		 297 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  25.44 
 
 		 311 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  26.19 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.57 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  28.5 
 
 		 401 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  31.78 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.58 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  23.32 
 
 		 285 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1036  cation diffusion facilitator family transporter  27.43 
 
 		 387 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.246594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  25.75 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  39.68 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  32.47 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  28.66 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  24.14 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  27.93 
 
 		 308 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  28.37 
 
 		 308 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2017  hypothetical protein  25.86 
 
 		 380 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 332 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  25.89 
 
 		 325 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  35.71 
 
 		 289 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2012  hypothetical protein  25.86 
 
 		 380 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  25 
 
 		 318 aa  41.6  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>