23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47026 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  100 
 
 
220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  24.26 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  30.85 
 
 
240 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  25.14 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  32.77 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  31.61 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  29.09 
 
 
328 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  28.04 
 
 
306 aa  52.4  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  25.76 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  29.53 
 
 
207 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  29.41 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  26.59 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  27.51 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  30.46 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  28.66 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  25.14 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  25.15 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  26.46 
 
 
317 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  31.06 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  24.53 
 
 
305 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  27.22 
 
 
256 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  26.94 
 
 
318 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>