70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1666 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  100 
 
 		 232 aa  450  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  89.61 
 
 		 235 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  71.62 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  73.3 
 
 		 221 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  65.66 
 
 		 215 aa  254  8e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  57.51 
 
 		 328 aa  238  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  60.68 
 
 		 240 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  64.5 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  62.63 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  56.31 
 
 		 296 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  61.8 
 
 		 243 aa  223  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  58.64 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  60.18 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  59.91 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  59.91 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  59.91 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  64.82 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  61.81 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  43 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  43 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  42.86 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  37.99 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  42.71 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  36.73 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  39.71 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  37.11 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  39.02 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  39.72 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  33.33 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35.26 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35.26 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  33.16 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.3 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  35.79 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  31.02 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1794  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  30.62 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 		 460 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2005  cation diffusion facilitator family transporter  28.26 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.09 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  28.49 
 
 		 401 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.84 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2889  cation diffusion facilitator family transporter  25.12 
 
 		 388 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000320508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  25.66 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  29.03 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  27.59 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  22.99 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  26.83 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 308 aa  45.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 		 312 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 		 291 aa  45.1  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1722  cation diffusion facilitator family transporter  24.87 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  19.43 
 
 		 312 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  21.98 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  26.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1788  cation diffusion facilitator family transporter  27.27 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0431575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  22.28 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  26.37 
 
 		 411 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  27.36 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  28.97 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2428  cation diffusion facilitator family transporter  26.25 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000439977  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4223  cation efflux protein  29.08 
 
 		 219 aa  42  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  36.73 
 
 		 308 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  34.29 
 
 		 289 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  31.34 
 
 		 332 aa  41.6  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>