54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3901 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3901  Co/Zn/Cd cation transporters-like protein  100 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0445  cation efflux protein  73.08 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4552  cation efflux protein  72.28 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4983  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  79.8 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4236  cation efflux protein  67.48 
 
 		 296 aa  272  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.52921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3938  cation efflux protein  69.74 
 
 		 202 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3316  cation efflux protein  70.26 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14660  predicted Co/Zn/Cd cation transporter  65.66 
 
 		 215 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.445676  normal  0.232746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4188  cation efflux protein  73.33 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4254  cation efflux protein  73.33 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347691  normal  0.0816672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4415  cation efflux protein  73.33 
 
 		 229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3670  cation efflux protein  75 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.306351  normal  0.190845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2718  putative integral membrane protein  71.64 
 
 		 238 aa  251  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5392  cation efflux protein  61.31 
 
 		 240 aa  234  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1729  cation efflux protein  64 
 
 		 221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1666  cation efflux protein  63.86 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1674  cation efflux protein  64.36 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.968978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5054  cation efflux protein  61.81 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3897  hypothetical protein  41.58 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3905  hypothetical protein  41.58 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.574712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7650  integral membrane protein  43.3 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11683  putative integral membrane protein  39.3 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0423  cation efflux protein  40.93 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3635  putative integral membrane protein  37.24 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13300  integral membrane protein  36.59 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1121  cation efflux protein  35.14 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1130  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  36.97 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.584235  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1451  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  35 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0515  hypothetical protein  33.16 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1190  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  30.93 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2001  hypothetical protein  34.03 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3416  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  31.73 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1876  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.63 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0692  hypothetical protein  33.84 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.11542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2347  Co/Zn/Cd cation transporter-like protein  32.63 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.440896  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0663  cation diffusion facilitator family transporter  24.32 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0132428  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.94 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0074  cation diffusion facilitator family transporter  22.34 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47026  predicted protein  29.75 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.580546  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0051  cation diffusion facilitator family transporter  22.35 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 		 311 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.91 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  24.86 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  27.54 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  26.06 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3150  cation diffusion facilitator family transporter  26.26 
 
 		 401 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  39.06 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  26.22 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  20.41 
 
 		 326 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1989  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.589418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.23 
 
 		 297 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  30.12 
 
 		 305 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>